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シソーラスに基づく医学論文の検索
2017/4/24 院内向け文献検索について
一歩先の文献検索。あなたはこれを何と呼びますか?
主題?統制語?MeSH??
???
藤原 崇志
倉敷中央病院 耳鼻咽喉科&臨床研究支援センター
理想的な文献検索
• 医学情報は膨大で、日々の業務も大変
– そして患者や臨床上の課題は待ってくれない。
– なるべく早く、正確な検索が必要
文献検索における課題①
• キーワードと思われる論文を入力しても全然違
うものが見つかるのですが・・・
– 同じ内容の論文でも、論文を書く人によって
登録しているキーワードが異なる
– 人によって、同じ物をみても同じ名前を思い浮かべ
るとは限らない
• あなたはこの絵をみてどんな言葉を思い浮かべ
ますか?
• 絆創膏?カットバン?それとも??
文献検索における課題①
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絆創膏が圧倒的に用いられる言葉!
但し、カットバンやバンドエイドで引っかかる論文も・・・
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• 適当に検索文字を入力すると、その検索文字を
含んだ言葉も一緒にひっかかってくる
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Cd(カドミウム) → CD(clostridium difficile)toxin
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→ CD22
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CDで検索するとICD(除細動器)、CDDP(抗がん剤)、
CDK(酵素)など色々ひっかかる・・・
より便利な検索に向けて
• 似たような言葉は同じ言葉に集約できないか?
• 集約した言葉で、論文をタグ付けできないか?
より便利な検索に向けて
• 似たような言葉は同じ言葉に集約したい
*絆創膏の集約した言葉(シソーラス)はないんですけどね・・・
統制した言葉
• シソーラス thesaurus(=統制語)
– ある概念をカテゴライズした言葉
(カットバン、絆創膏、バンドエイド etc)
– カテゴリー間は上下関係で体系化されている
*シソーラス=統制語だと思いますが違ったらすみません。
統制した言葉
– カテゴリー間の上下関係の例(PubMedの
全ての統制語(シソーラス)
カテゴリー:病気
カテゴリー:癌/悪性腫瘍
カテゴリー:
頭頚部癌
統制した言葉
• 統制語/シソーラスの注意点
– 論文を探すデータベースによって名前が違う
MEDLINE EMBASE CENTRALデータベース
データベースを
検索する方法
Ovid
MEDLINE
PubMed Embase CENTRAL
データベースの
シソーラス
MeSH MeSH EMTREE MeSH
統制語/シソーラスの付加
– 統制語は文献を医学中央雑誌などのデータベースに
登録される際、人手によって統制語が付与されてます。
http://www.jamas.or.jp/user/database/keyword.html
理想的な文献検索の実践へ
• せっかく統制語/シソーラスを論文に付与してく
れてるなら、利用するにこしたことはない。
• シソーラスを用いて短時間で自分に興味のある
論文だけを検索しよう!
調べたいシソーラスが知りたい!
• シソーラスにどんなものがあるか知りたい
• 自分が読んでいる論文のシソーラスが知りたい
PubMedの場合
①赤矢印部分をPull downしてMeshに変更
②次に自分の調べたいキーワードを入力して検索
①
②
PubMedの場合
①このように可能性のあるシソーラス(Mesh)が
検索されてきます。今回だと一番上が該当しそう
医学中央雑誌の場合
①シソーラス参照し、②シソーラスブラウザをクリック
③確認したいキーワードを入力し、④検索ボタンをクリック
①
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医学中央雑誌の場合
階層表示をクリックすると、
全てのシソーラスが表示されます。
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①
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③シソーラスと思われるものを入力し検索
調べたいシソーラスが知りたい!
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• 自分が読んでいる論文のシソーラスが知りたい
PubMedの場合
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PubMedの場合
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医学中央雑誌の場合
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より便利な検索に向けて
• 自分が調べようとしている論文に、よく付与され
ているシソーラスは分かったけど・・・
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シソーラスを用いた検索
– 検索語を二重引用符で囲い、 [mesh]つけて検索
– Advanced searchで検索語をPull downして
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シソーラスを用いた検索
– PubMedの使い方(東京大学 医学図書館)
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– MeSHから検索する(日本医科大学図書館)
http://libserve.nms.ac.jp/manual5/pubmed/pubmedmanual5.pdf
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http://spell.umin.jp/PubMedSearchingMethod2.2.pdf
シソーラスを用いた一歩先の検索
• 気が向いたらシソーラスを用いた系統的検索
(漏れのない検索)に応用してみてください。
医療情報の検索
https://www.slideshare.net/takashifujiwara71/ss-47140149
診断精度研究の系統的レビュー作成のための文献検索
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