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統制語、シソーラス、MeSH?に基づく医学論文の検索
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Takashi Fujiwara
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シソーラスの説明を繰り返すことになったので、シソーラスやMeSHやら統制語についてまとめました。
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1.
1 シソーラスに基づく医学論文の検索 2017/4/24 院内向け文献検索について 一歩先の文献検索。あなたはこれを何と呼びますか? 主題?統制語?MeSH?? ??? 藤原 崇志 倉敷中央病院
耳鼻咽喉科&臨床研究支援センター
2.
理想的な文献検索 • 医学情報は膨大で、日々の業務も大変 – そして患者や臨床上の課題は待ってくれない。 –
なるべく早く、正確な検索が必要
3.
文献検索における課題① • キーワードと思われる論文を入力しても全然違 うものが見つかるのですが・・・ – 同じ内容の論文でも、論文を書く人によって 登録しているキーワードが異なる –
人によって、同じ物をみても同じ名前を思い浮かべ るとは限らない
4.
• あなたはこの絵をみてどんな言葉を思い浮かべ ますか? • 絆創膏?カットバン?それとも?? 文献検索における課題①
5.
医学中央雑誌の検索状況 絆創膏が圧倒的に用いられる言葉! 但し、カットバンやバンドエイドで引っかかる論文も・・・
6.
文献検索における課題② • 適当に検索文字を入力すると、その検索文字を 含んだ言葉も一緒にひっかかってくる – 例1) Cd(カドミウム)
→ CD(clostridium difficile)toxin → CD-ROM → CD22 – 例2) がん(癌) → “がん”こ → 白血病はひっかからない?
7.
医学中央雑誌の検索状況 CDで検索するとICD(除細動器)、CDDP(抗がん剤)、 CDK(酵素)など色々ひっかかる・・・
8.
より便利な検索に向けて • 似たような言葉は同じ言葉に集約できないか? • 集約した言葉で、論文をタグ付けできないか?
9.
より便利な検索に向けて • 似たような言葉は同じ言葉に集約したい *絆創膏の集約した言葉(シソーラス)はないんですけどね・・・
10.
統制した言葉 • シソーラス thesaurus(=統制語) –
ある概念をカテゴライズした言葉 (カットバン、絆創膏、バンドエイド etc) – カテゴリー間は上下関係で体系化されている *シソーラス=統制語だと思いますが違ったらすみません。
11.
統制した言葉 – カテゴリー間の上下関係の例(PubMedの 全ての統制語(シソーラス) カテゴリー:病気 カテゴリー:癌/悪性腫瘍 カテゴリー: 頭頚部癌
12.
統制した言葉 • 統制語/シソーラスの注意点 – 論文を探すデータベースによって名前が違う MEDLINE
EMBASE CENTRALデータベース データベースを 検索する方法 Ovid MEDLINE PubMed Embase CENTRAL データベースの シソーラス MeSH MeSH EMTREE MeSH
13.
統制語/シソーラスの付加 – 統制語は文献を医学中央雑誌などのデータベースに 登録される際、人手によって統制語が付与されてます。 http://www.jamas.or.jp/user/database/keyword.html
14.
理想的な文献検索の実践へ • せっかく統制語/シソーラスを論文に付与してく れてるなら、利用するにこしたことはない。 • シソーラスを用いて短時間で自分に興味のある 論文だけを検索しよう!
15.
調べたいシソーラスが知りたい! • シソーラスにどんなものがあるか知りたい • 自分が読んでいる論文のシソーラスが知りたい
16.
PubMedの場合 ①赤矢印部分をPull downしてMeshに変更 ②次に自分の調べたいキーワードを入力して検索 ① ②
17.
PubMedの場合 ①このように可能性のあるシソーラス(Mesh)が 検索されてきます。今回だと一番上が該当しそう
18.
医学中央雑誌の場合 ①シソーラス参照し、②シソーラスブラウザをクリック ③確認したいキーワードを入力し、④検索ボタンをクリック ① ② ③ ④
19.
医学中央雑誌の場合 階層表示をクリックすると、 全てのシソーラスが表示されます。
20.
Cochrane Centralの場合 http://www.cochranelibrary.com/ ① ② ③シソーラスと思われるものを入力し検索
21.
調べたいシソーラスが知りたい! • シソーラスにどんなものがあるか知りたい • 自分が読んでいる論文のシソーラスが知りたい
22.
PubMedの場合 Publication type, MeSH
termsをクリック
23.
PubMedの場合 その論文に付与されたMeSH等が確認できる。
24.
医学中央雑誌の場合 • 論文を選択すると、こんな感じで書いてます。
25.
より便利な検索に向けて • 自分が調べようとしている論文に、よく付与され ているシソーラスは分かったけど・・・ • そのシソーラスで検索するにはどうしたら??
26.
シソーラスを用いた検索 – 検索語を二重引用符で囲い、 [mesh]つけて検索 –
Advanced searchで検索語をPull downして Mesh Termsに変更し、検索
27.
シソーラスを用いた検索 – PubMedの使い方(東京大学 医学図書館) http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf –
MeSHから検索する(日本医科大学図書館) http://libserve.nms.ac.jp/manual5/pubmed/pubmedmanual5.pdf – 最もシンプルで分かりやすいPubMed検索法(pES club) http://spell.umin.jp/PubMedSearchingMethod2.2.pdf
28.
シソーラスを用いた一歩先の検索 • 気が向いたらシソーラスを用いた系統的検索 (漏れのない検索)に応用してみてください。 医療情報の検索 https://www.slideshare.net/takashifujiwara71/ss-47140149 診断精度研究の系統的レビュー作成のための文献検索 https://www.slideshare.net/srws/3-66366580
29.
参考資料
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