Cette présentation couvrira des méthodes et des outils utilisés pour rassembler, enregistrer et disséminer l'information chimique utilisant la Science par Cahier de Laboratoire Ouvert, la pratique de rendre un cahier de laboratoire et tous données brutes associées disponibles publiquement aussitôt que possible. Des mesures de solubilité et les réactions de chimie organique sont manipulées de cette façon. L'enregistrement des données de laboratoire est manipulé principalement utilisant des centres serveurs libres et tels que Wikispaces et Feuilles de Calcul de Google. L'information est rendue découvrable utilisant les voies de transmission superflues, y compris Google, Wikipedia et d'autres véhicules. L'abstraction des éléments clé des mesures de solubilité et des réactions chimiques permet la consommation automatisée de l’information. Les implications pour le futur de l'automation du processus scientifique basé sur des données ouvertes et des services ouverts seront discutées.

1. La Science par Cahier de Laboratoire Ouvert Jean-Claude Bradley Mai 9, 2011 ACFAS: Une Autre Science est Possible Professeur de chimie Université Drexel

2. L'industrie partage de plus en plus de ses données

3. Possibilités de collaboration compétitive

4. Quelques initiatives pour la promotion de transparence dans la découverte de médicaments

5. La Science par Cahier de Laboratoire Ouvert

6. Il n'existe pas de faits, seulement des valeurs mesurées La Science par Cahier de Laboratoire Ouvert maintient l'intégrité de la provenance des données en mettant le contexte des mesures explicite

7. CONFIANCE PREUVE

8. Premièrement enregistrer et par la suite structurer Afin d'être découvrable, utiliser des formats favorable pour Google (HTML simple, aucun mot de passe) Afin d'être reproductible libre utilisation des outils gratuits (Wikispaces, Google Spreadsheets) Stratégie pour un cahier de laboratoire ouvert :

9. Projet UsefulChem: la recherche fondamentale ouverte dans la conception de médicaments en utilisant des outils Web2.0 Docking Synthèse Essais Rajarshi Guha Indiana U JC Bradley Drexel U Phil Rosenthal UCSF (paludisme) Dan Zaharevitz NCI (tumeurs) Tsu-Soo Tan Nanyang Inst.

10. Cible pour le paludisme: falcipain-2 impliqué dans le métabolisme d'hémoglobine Dana.org

11. La reaction de Ugi

12. Résultat de la collaboration Guha-Bradley-Rosenthal

13. Les références aux articles, blogs, pages cahier de laboratoire, les données brutes

14. La réaction de Ugi: peut-on prédire les précipitations? Peut-on prédire la solubilité dans les solvants organiques?

15. La collecte de données sur la solubilité par « crowdsourcing »

16. Juges pour le concour de solubilité

17. Gagnants du concour de solubilité

18. Les mesures de solubilité recueillies dans une feuille de calcul Google

19. Requête Web basé sur la feuille de calcul Google (Rajarshi Guha)

20. Provenance des données: Un article de Wikipédia conduit...

21. … au cahier de laboratoire et les données brutes

22. Spectres RMN interactifs utilisant JSpecView et JCAMP-DX

23. (Andy Lang, Tony Williams) Spectres à partir de données ouverte pour l'enseignement (Andy Lang, Tony Williams, Robert Lancashire)

24. Données brutes en images Splatter? Some liquid

25. YouTube pour démontrer les expériences

26. L'importance de la disponibilité des données brutes Manqué dans une publication préalable sur la solubilité de ce composé

27. Etude de cas : Cours de Recherche d‘Information Chimique à Drexel ( automne 2009/2010) Optimisation du système éducatif pour contribuer nouvelle science

28. La fiche de validation de l'information chimique 567 mesures vérifiées et référencées

29. L'explorateur de validation de l'information chimique (Andrew Lang)

30. Découvrir les valeurs aberrantes pour des points de fusion

31. Recherche de l‘ incohérence du p.f. de EGCG

32. Recherche de l’ incohérences du p.f. de cyclohexanone

33. Sigma-Aldrich, Acros and Wolfram Alpha utilisent apparemment les mêmes sources pour les points de fusion

34. Sigma-Aldrich, Acros and Wolfram Alpha utilisent apparemment les mêmes sources pour les points d'ébullition

35. Sigma-Aldrich, Acros and Wolfram Alpha utilisent apparemment PAS les mêmes sources pour les points d'éclair

36. Sources de données les plus utilisés

37. Alfa Aesar fait don de leurs points de fusion au public

38. Explorateur de Point de fusion

39. Valeurs aberrantes MDPI dataset EPI (via ChemSpider)

40. Valeurs aberrantes Alfa Aesar

41. Les incohérences et les problèmes de SMILES dans le dataset MDPI

42. Ensemble de données MDPI étiquetés avec un Haut Niveau de confiance

43. Ensembles de données de points de fusion

44. Modélisation de données ouvertes de point de fusion utilisant les descripteurs de CDK (Andrew Lang) R2 = 0.78, TPSA and nHdon most important

45. Service de prediction de point de fusion

46. Autres services web … (Andrew Lang) Modélisation de solubilité

47. Services Web dans une feuille de calcul Google (Andrew Lang)

48. Intégration des services Web multiples à Recommander Solvants pour réactions (Andrew Lang)

49. Utilisation de point de fusion pour la prédiction de la solubilité dépendante de la température

52. Livre Reaction Attempts

53. Reactions

55. Services Web

56. Archives

57. Livre de Solubilite cite pour une application de nanotechnologie

58. (Don Pellegrino) Carte sociale de chercheurs et produits chimiques

59. Decanoic acid Water NaCl

60. Recherche pour les applications de la solubilité sur le cancer du sein

61. Solubilité prévisée pour le Taxol Pred Exp

62. Prédictions de la solubilité du Taxol dans l’eau selon la température (M)